El V Plan Director de la Cooperación Española 2018-2021 incluye Mozambique en sus prioridades geográficas, integrándolo en el grupo de Países de Asociación Menos Avanzados. El marco jurídico de la Cooperación con Mozambique lo constituye el Convenio Básico de Cooperación firmado en 1980.
El 21 de noviembre de 2014 se firmó en Maputo el
Marco de Asociación España-Mozambique (MAP), ratificado mediante Comisión Mixta de Cooperación el 15 de abril de 2015, que establece el marco estratégico de la cooperación entre ambos países para el periodo 2014-2016 y, de acuerdo con las necesidades y demandas expresadas por las autoridades y sociedad civil de Mozambique, define tres sectores de concentración: gobernabilidad (gestión de finanzas públicas y descentralización), desarrollo rural/seguridad alimentaria y salud.
Geográficamente, la actuación de la AECID se concentra en la provincia de Cabo Delgado. Inhambane y Maputo son consideradas provincias de atención especial.
A lo largo de 2018 se prevé la elaboración de un nuevo MAP, en el que dentro de las directrices del V Plan director se reflejarán las prioridades establecidas por las autoridades de Mozambique en coordinación con todos los actores de la Cooperación Española.