El procedimiento de calificación de ONGD viene regulado en la ORDEN AEC/1303/2005, de 27 de abril, por la que se regulan las bases para la concesión de subvenciones a organizaciones no gubernamentales de desarrollo, para la realización de intervenciones en materia de cooperación internacional para el desarrollo.

La Resolución de 22 de abril de 2009 es la norma actualmente en vigor que desarrolla lo establecido en la Orden de Bases. Esta Resolución contiene tres apartados:

I.- Procedimiento de obtención de la calificación.

II.- Revisión de la condición de ONGD calificada.

III.- Revocación de la condición de ONGD calificada por causas especiales.