El Programa de Cooperación Interuniversitaria e Investigación Científica surgió con la Convocatoria 2003 como evolución del antiguo INTERCAMPUS, abarcando a los diecinueve países iberoamericanos, a Túnez y Marruecos. Fue con la Convocatoria de 2007 cuando se reúnen a estos dos países dentro del área del Mediterráneo e incluyendo la participación de Egipto, Jordania y Argelia. En el año 2010 se unifica en una convocatoria que incluye a los países antes mencionados más los dos nuevos donde se abre el Programa, Haití y Filipinas, quedando englobadas las cuatro áreas geográficas como son Iberoamérica, Mediterráneo, África Subsahariana y Asia . Por el momento, el último PCI convocado ha sido en el año 2011.
